2010 yılında Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi Rektörlüğü’ne bağlı olarak kurulan Fen Bilimleri Enstitüsü, temel mühendislik ve doğa bilimleri alanlarında yüksek lisans ve doktora eğitimi vermek, öğrencilerine danışmanlık yapmak, öğrencilerin çalışmalarını denetlemek ve bilimsel projeleri teşvik amacıyla kurulmuştur. Enstitümüzde sürdürülen lisansüstü çalışmalar öncelikli olarak; temel kavramları en derin şekilde anlamış, kendi özel çalışma alanlarında en gelişmiş teknik ve yöntemleri kullanan bilimsel ve teknolojik gelişmeleri izleyen mühendisler ve bilim insanları yetiştirmeyi hedeflemektedir. Fen Bilimleri Enstitüsü, ulusal ve uluslararası ihtiyaçlara odaklanmış olduğundan ulusal ve uluslararası bilimsel eğilimleri en güncel şekilde takip etmekte aynı zamanda öğrencileri en güncel teorik ve uygulama bilgi ve becerileri ile derin ve detaylı bir şekilde donatma gayretindedir.